Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TIMMDC1Q9NPL8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms