Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IL1RAPQ9NPH3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL1RAPQ9NPH3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms