Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms