Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMYD3Q9H7B4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMYD3Q9H7B4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms