Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHACTR1Q9C0D0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms