Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM4Q9C037 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms