Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TDRD1Q9BXT4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms