Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms