Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX2Q99697 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms