Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JSRP1Q96MG2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms