Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CELF6Q96J87 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms