Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
ZCCHC13Q8WW36 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms