Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHX4

SPATA3, Spermatogenesis-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA3Q8NHX4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPATA3Q8NHX4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SPATA3Q8NHX4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SPATA3Q8NHX4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SPATA3Q8NHX4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SPATA3Q8NHX4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SPATA3Q8NHX4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SPATA3Q8NHX4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SPATA3Q8NHX4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SPATA3Q8NHX4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPATA3Q8NHX4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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