Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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