Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms