Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XIRP1Q702N8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP1Q702N8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP1Q702N8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP1Q702N8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP1Q702N8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP1Q702N8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP1Q702N8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP1Q702N8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP1Q702N8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP1Q702N8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XIRP1Q702N8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms