Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC9A4Q6AI14 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms