Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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COL5A1-AS1Q5SY13 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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COL5A1-AS1Q5SY13 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
COL5A1-AS1Q5SY13 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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COL5A1-AS1Q5SY13 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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