Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALFQ53S48 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ALFQ53S48 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms