Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPAT3Q53EU6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms