Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms