Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM1Q2NKQ1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM1Q2NKQ1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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