Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GEN1Q17RS7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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