Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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