Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZFHX3Q15911 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms