Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PUM3Q15397 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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