Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRRQ15256 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms