Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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