Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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