Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRQ13535 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ATRQ13535 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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