Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPM6BQ13491 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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