Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCIRG1Q13488 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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