Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRSF5Q13243 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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