Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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MRPL28Q13084 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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MRPL28Q13084 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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MRPL28Q13084 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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MRPL28Q13084 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms