Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 453.5 ms