Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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