Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB3Q05901 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms