Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms