Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XPCQ01831 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XPCQ01831 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XPCQ01831 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms