Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYBPC1Q00872 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYBPC1Q00872 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYBPC1Q00872 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYBPC1Q00872 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYBPC1Q00872 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms