Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms