Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG7P83436 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG7P83436 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COG7P83436 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG7P83436 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG7P83436 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG7P83436 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COG7P83436 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG7P83436 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG7P83436 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG7P83436 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG7P83436 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG7P83436 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG7P83436 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG7P83436 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COG7P83436 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms