Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMF1P82094 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMF1P82094 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMF1P82094 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMF1P82094 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMF1P82094 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMF1P82094 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms