Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms