Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCR4P61073 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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