Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB25P57735 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms