Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms