Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP2P53365 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms