Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCR4P51679 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms