Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX2P50458 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX2P50458 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms